虽然有充分的实验证据表明物种多样性在生态系统性能中的作用，但遗传多样性的功能意义尚不清楚。事实上，许多水生植物群落生产力很高，尽管它们只由少数或单一的优势物种组成。为了阐明这一明显的矛盾，湖沼学MPI的科学家们操纵了该领域海草Zostera marina的基因型多样性。该实验于2003年在波罗的海进行。在那一年里，热浪导致地表水温度上升到25°C以上，导致浅水动植物普遍因热应激而死亡。这样的条件可以作为预测极端气候增加的模型。热浪过后，在实验期结束时，基因型多样的海草区恢复得更快，有更多的芽和生物量，并有更多的相关无脊椎动物。基因型多样性的积极影响是由于真正的生物多样性效应（互补性），而不是由于特别抗性基因型的优势。这些结果提供了实验证据，证明不仅要保护物种多样性，还要保护遗传多样性。基因型多样性与物种多样性具有相似的功能。这样，可以将遗传多样性水平纳入现有的物种层面的生物多样性生态学理论。