尼古丁乙酰胆碱受体基因的重测序及其常见和罕见变体与尼古丁依赖性Fagerstrom试验的相关性

Resequencing of Nicotinic Acetylcholine Receptor Genes and Association of Common and Rare Variants with the Fagerstrom Test for Nicotine Dependence

【作者】 SRI International

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烟碱型乙酰胆碱受体(nAChR)亚基基因的常见单核苷酸多态性(SNPs)以前与尼古丁依赖性的测量有关。我们研究了nAChR基因中常见的SNPs和罕见的单核苷酸变异(SNV)对寻求治疗的吸烟者尼古丁依赖性(FTND)分数的Fagerström测试的贡献。在448名戒烟试验的欧美参与者中,用下一代测序技术对10个基因的外显子进行了重新测序,并用Sanger技术对CHRNB2和CHRNA4进行了重新排序,以提高序列覆盖率。共鉴定出214个SNP/SNV,其中19.2%因完成率降低而被排除在分析之外,73.9%的次要等位基因频率<5%,48.1%是相对于dbSNP构建129的新等位基因。我们使用从430名个体(18人因完成率降低而被排除)获得的数据,对173个SNP/SNV与FTND评分的相关性进行了测试,对常见的使用线性回归,对罕见的使用队列等位基因和检验和加权和统计,对常见和罕见的SNP/SNVs使用多变量距离矩阵回归方法。对常见SNPs进行关联测试,并对每个基因内的相关测试进行调整,发现与两个CHRNB2 SNPs存在显著关联,例如rs2072660的次要等位基因使平均FTND得分增加了0.6 单位(P=0.01)。我们观察到了与CHRNA5和CHRNB2常见和罕见SNP/SNV以及CHRNA4罕见SNV的FTND评分相关的重要证据。在该寻求治疗的吸烟者样本中,来自多个nAChR亚基基因的常见和/或罕见SNP/SNV都与FTND评分相关。

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