MetaCyc数据库(http://metacyc.org)是通过手动管理从文献中收集的来自各种生物体的一千多种代谢途径的集合。BioCyc包含370多个途径/基因组数据库,每个数据库都描述了单个生物体的基因组和预测的代谢途径,如使用MetaCyc数据作为参考,从注释的基因组中计算预测的那样。本单元中的协议向用户介绍MetaCyc和BioCyc中提供的广泛数据内容,以及使用Pathway Tools软件查询、可视化和分析这些数据的机制。Curr。Protoc。生物信息。20:1.17.1-1.17.51。©2007 John Wiley&Sons,股份有限公司。