Bacteria
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国际边界和水资源委员会美国分部管理着美墨边境的两个废水处理厂,处理主要来自墨西哥的未经处理的污水。但人口增长和工厂基础设施老化使雨水将细菌、垃圾和沉积物从墨西哥带入美国,影响了亚利桑那州和加利福尼亚州的公共健康和环境

2020-02-05
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质粒RK2在广泛的革兰氏阴性菌中稳定复制的能力是不寻常的。复制起源(oriV)和质粒编码的起始蛋白(TrfA;以33和44kDa的形式表达)对于RK2复制是必需的。为了检测与大肠杆菌无关的细菌中的起始事件,分离编码恶臭假单胞菌和铜绿假单胞菌的复制解旋酶DnaB的基因,并将其用于构建蛋白质表达载体。将纯化的蛋白质与E.coli DnaB一起在RK2-oriV下测试活性。在宿主特异性DnaA蛋白和TrfA蛋白的存在下,每种解旋酶都可以在RK2起源处被募集和激活。大肠杆菌或P.putida DnaB对TrfA-33或TrfA-44具有活性,而铜绿假单胞菌DnaB需要TrfA-4才能激活。此外,与大肠杆菌DnaB解旋酶不同,在没有ATP酶辅助蛋白的情况下,两种假单胞菌解旋酶都可以在oriV下递送和激活。因此,在复制起点装载必需的复制解旋酶并不普遍需要DnaC样辅助ATP酶。

2001-06-01
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利用趋磁细菌的磁共振成像技术观察小鼠植入肿瘤

2009-08-01
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合成了天然产物抗生素新生物素的衍生物,以改善其理化性质。使用曼尼奇反应在分子的溶剂暴露位置引入新的侧链,并在该位置评估不同的官能团。测试了Novobicin及其新衍生物与旋转酶B的结合以及对金黄色葡萄球菌、结核分枝杆菌、兔弗朗西斯杆菌和大肠杆菌的抗菌活性。尽管新的衍生物仍然有效地结合了旋转酶B蛋白(0.07–1.8μM,IC50),但它们的抗菌活性显著降低。鉴定出两种化合物对M。最小抑菌浓度为2.5μg/ml。

2011-10-01
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2-氯-5-硝基-N-苯基苯甲酰胺(GW9662)是一种有效的不可逆PPAR-γ拮抗剂,已显示出作为癌症化学预防剂的前景,并正在进行临床前评估。在亚慢性口服毒性评估之前,已开始研究评估其在两种动物中的细菌致突变性和药代动力学特征,结果报告于此。GW9662在具有和不具有代谢活化的TA98和TA100菌株中均具有诱变性,但在具有和未具有代谢活化作用的硝基还原酶缺陷菌株(TA98NR和TA100NR)中呈阴性,表明GW9662的诱变性依赖于硝基还原。诱变活性主要通过碱基取代机制。在大鼠和狗中口服给药后,血浆样品中几乎没有母体化合物GW9662,但有色谱证据表明,由于口服给药,血浆中存在代谢物。代谢产物鉴定研究表明,胺代谢产物ACPB(5-氨基-2-氯-N-苯基苯甲酰胺)是硝基还原的产物,是表现出大而持久的血浆水平的主要物种。因此,GW9662的系统循环主要以其还原代谢产物的形式实现,可能是肠道细菌代谢的产物。GW9662在静脉给药后在大鼠和狗的血浆中可检测到,尽管浓度较低。大鼠静脉给药后的药代动力学分析显示,清除迅速,组织分布广泛,这可能是血浆水平非常低的原因。值得注意的是,在大鼠和狗的静脉给药后,胺代谢产物都不存在,这证实了它是系统前代谢的产物。GW9662作为化学预防剂的潜在用途,特别是作为雌激素受体-α(ER-α)诱导剂在其他ER-α阴性乳腺组织中的潜在用途是非常令人感兴趣的。然而,本文显示的结果表明,需要进行额外的动物毒理学和生物利用度研究,以确定GW9662作为化学预防剂的作用。

2012-04-01
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对致命腹泻疾病的易感性部分是由于儿童普遍缺乏维生素A。为了增加营养不良儿童的维生素A覆盖率,我们建议设计一种益生菌,它会在肠道中产生β-胡萝卜素,并将其代谢为维生素A。这种疗法有可能广泛刺激粘膜免疫,同时降低腹泻病的发病率和持续时间。为此,产生了益生菌大肠杆菌菌株Nissle 1917的产生β-胡萝卜素的变体(EcN BETA)。值得注意的是,该菌株在厌氧条件下产生β-胡萝卜素,反映了肠道环境。EcN-BETA在冷冻干燥后也保留了β-胡萝卜素的生产能力,这表明它可能适合干燥配方。此外,EcN-BETA在体外激活小鼠树突状细胞,表明β-胡萝卜素的存在可能不会降低EcN的免疫刺激能力。最后,我们提出了一个框架,通过该框架,进一步的改进可以使本报告中描述的方法为发展中国家提供创新的拯救生命的疗法。

2013-06-01
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PortEco(http://porteco.org)旨在收集、策划和提供数据和分析工具,以支持大肠杆菌(以及最终其他细菌系统)的基础生物学研究。PortEco被实现为一个“虚拟”模型生物体数据库,为用户提供单一的统一界面,同时集成来自各种来源的信息。PortEco的主要重点是广泛使用越来越多的大肠杆菌高通量实验,并通过EcoliWiki和GONUTS系统利用社区注释。目前,PortEco包括数百项全基因组RNA表达研究的精选数据,数百种注释条件下单基因敲除的高通量表型,数十种不同DNA结合因子的染色质免疫沉淀实验,以及深入了解蛋白质表达的核糖体图谱实验。条件已经用一致的词汇表进行了注释,数据也得到了一致的规范化,使用户能够找到、比较和解释相关实验。PortEco包括用于数据分析的工具,包括通过基因组浏览器进行聚类、富集分析和探索。PortEco搜索和数据分析工具与其姊妹网站EcoCyc的策划基因、代谢途径和调节内容广泛相关。

2014-01-01
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有害生物(细菌、寄生虫和害虫)对抗生素、抗疟药和杀虫剂等控制剂的广泛使用所带来的选择压力的抵抗力不断增强,这在医学和农业中都是一个严重的问题。对耐药性进行建模——或者反过来,对这些控制剂作为生物资源的有效性进行建模——可以深入了解如何对这些制剂进行最佳管理,以最大限度地提高其对社会的经济效益。本文使用细菌对抗生素耐药性的进化模型——在该模型中,耐药性使耐药生物处于进化劣势——开发了一种简单的抗生素最佳使用顺序算法。尽管这个问题的解决方案遵循了公认的按边际成本增加的顺序使用资源的规则,但这些经济成本产生于不同生物特征的独特方式将这个问题与自然资源领域的其他问题区分开来。本文还研究了在两种或多种抗生素之间周期性轮换的选择,并描述了循环策略优于同时使用两种或更多抗生素的经济和生物学标准。

2001-06-01
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脑微透析检测动脉瘤性蛛网膜下腔出血患者细菌性脑膜炎的队列研究

2009
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丝状蓝藻 Planktothrix rubescens 和 Planktothrix agardhii 种群中微囊藻毒素基因型的多样性

2006
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