尽管人们对长期饮酒对大脑结构的破坏性影响进行了广泛的描述，但对所观察到的变化的机制解释才刚刚出现。为了研究慢性乙醇治疗后大脑蛋白质表达水平的局部变化，每对雄性Wistar大鼠中有一只大鼠暴露于间歇性（14小时/天）蒸发乙醇中，另一只暴露于空气中26周。在暴露于蒸汽的24周结束时，乙醇组的血液乙醇水平平均为450 mg%，没有经历过长期（>16小时）的乙醇戒断，并且仅显示出轻微的肝脂肪变性迹象。对提取的大脑进行显微解剖，分离出前额叶皮层（PFC）、背侧纹状体（STR）、胼胝体膝（CCg）、CC体（CCb）、前朱部（AV）和前背侧小脑（ADLC），用二维凝胶电泳进行蛋白质分析。54个蛋白质斑点的表达水平在乙醇处理组和空气处理组之间有显著差异。在这54种蛋白质中，串联质谱法成功鉴定了39种独特的蛋白质，其水平通过乙醇处理而改变：13种在PFC中，7种在STR中，2种在CCg中，7个在CCb中，7项在AV中，5项在ADLC中。慢性乙醇暴露改变的蛋白质功能主要与PFC中的神经递质系统和STR中的细胞代谢有关。应激反应蛋白仅在PFC、AV和ADLC中升高，这可能支持了酒精中毒中额脑回路破坏的作用。在剩余的蛋白质中，一些具有与细胞骨架生理学相关的功能（例如，在CCb中），另一些具有与转录/翻译相关的功能，例如，在ADLC中。综合考虑，本研究中鉴定的39种蛋白质中，除4种外，其余均已在乙醇基因和/或蛋白质表达研究中鉴定，支持其在乙醇相关大脑改变中的作用。