人们越来越认识到，通路分析——一种对结果与生物通路中一组单核苷酸多态性（SNPs）之间相关性的联合测试——可能会补充单核苷酸多态性分析，并为复杂疾病的遗传结构提供更多的见解。在现有P值组合方法的基础上，我们提出了一类基于自适应秩截断乘积统计的高度灵活的通路分析方法，该方法可以有效地组合通路内不同SNPs和基因的关联证据。使用高效排列算法来评估通路水平测试统计的统计显著性，该算法在计算上仍然可行，而不管通路的大小和用于总结SNP和基因水平关联的基础测试统计的复杂性如何。我们通过模拟研究证明，将潜在基因（而不是潜在SNPs）作为假设检验的基本单位的基于基因的分析是一种非常稳健和强大的基于途径的关联检验方法。我们还通过研究烟碱受体途径与吸烟行为之间的关系来说明所提出的方法的优势。Genet。流行病学。33:700–7092009。2009年出版，Wiley-Liss，股份有限公司。