一种维护多数据库引用完整性的协议

A Protocol for Maintaining Multidatabase Referential Integrity

【作者】 Peter Karp

PDF下载
查看原文
分享到:
生物信息学界越来越依赖于在生物数据库(DB)之间创建链接,以此作为数据库互操作性的基础。例如,可以通过将基因对象的唯一标识符(id)存储在蛋白质对象的属性中,从一个DB中的蛋白质(如PIR)到另一个DB(如GDB)中的基因创建链接。然后,用户界面可以支持从蛋白质到基因的导航,多数据库查询可以将蛋白质与基因连接起来。该基因的唯一id充当外键。然而,多种因素,如底层生物学的变化,可能会导致对象ID无效,从而在DB之间产生无效链接。无效链接违反了多数据库引用完整性。我们提出了一种网络协议,通过该协议,数据库管理员可以通过互联网提供有关其数据库中对象标识符更改的信息,以允许其他数据库保持引用完整性。我们要求生物信息学界发表意见,以便就拟议的方案达成共识。

相关资源