路径数据库收集定义生命过程的生物反应和分子相互作用。MetaCyc通路数据库家族由数千个数据库组成,这些数据库是通过MetaCyc途径/基因组数据库(PGDB)中代谢途径的计算推断得出的。在某些情况下,这些数据库随后进行了手动管理。大多数主要模式生物现在都可以使用固化途径数据库。MetaCyc家族中的数据库使用Pathway Tools软件进行管理。本章介绍了对MetaCyc通路数据库家族进行数据挖掘的方法。我们讨论了该族的主要数据访问机制,其中包括多种格式的数据文件;Lisp、Java和Perl语言的应用程序编程接口(API);以及网络服务。我们概述了Pathway Tools模式,了解查询数据库所需的模式。本章还介绍了Pathway tools中用于执行组学数据分析的几个交互式数据挖掘工具。
“技术挖掘”是一个用于分析科学、技术和创新 (“ST&I”) 信息资源的多步骤过程。 它使用文本挖掘、可视化和通信工具来提供 ad_x0002_dress 技术问题管理所需的经验知识。 技术挖掘可以帮助评估成熟或新兴的科学技术领域,例如纳米技术。 在这里,我们描述了关于纳米增强、薄膜太阳能电池和染料敏化太阳能电池的相关 ST&I 数据的选择分析和可视化。 这些分析有助于确定互补性和竞争性研究活动、评估研究生产力、评估研究跨学科性、了解纳米技术发展轨迹,以及确定和预测有前途的纳米应用。